Основни задатак свих делатности центра је унапређење здравља становништва.
Такав циљ постиже се путем унапређења стања животне средине, уз интердисциплинарни и превентивни приступ. Центар се бави мерењем, анализом и праћењем микробиолошких, физичких и хемијских фактора животне средине који могу, посредно или непосредно, утицати на здравље становништва.
Наведене активности се односе на мониторинг фактора животне средине: воду за пиће, површинске и подземне воде, отпадне воде, воде за рекреацију, животне намирнице, предмете опште употребе, ваздух, земљиште, праћење хигијенско-санитарних прилика у установама од јавног значаја и унапређење исхране становништва.
Осим идентификације, обављају се процене и праћења фактора ризика по здравље становнштва, Центар даје препоруке мера које смањују или сузбијају неповољне факторе или утицаје на здравље становништва.
Центар својим здравствено васпитним активностима промовише здраве стилове живота.
Центар води евиденције, прикупља и обрађује податке и извештава надлежне државне службе, службе локалне самоуправе, здравствене установе о резултатима рада у појединим сегментима, као и јавност, путем средстава јавног информисања.