Osnovni zadatak svih delatnosti centra je unapređenje zdravlja stanovništva.
Takav cilj postiže se putem unapređenja stanja životne sredine, uz interdisciplinarni i preventivni pristup. Centar se bavi merenjem, analizom i praćenjem mikrobioloških, fizičkih i hemijskih faktora životne sredine koji mogu, posredno ili neposredno, uticati na zdravlje stanovništva.
Navedene aktivnosti se odnose na monitoring faktora životne sredine: vodu za piće, površinske i podzemne vode, otpadne vode, vode za rekreaciju, životne namirnice, predmete opšte upotrebe, vazduh, zemljište, praćenje higijensko-sanitarnih prilika u ustanovama od javnog značaja i unapređenje ishrane stanovništva.
Osim identifikacije, obavljaju se procene i praćenja faktora rizika po zdravlje stanovnštva, Centar daje preporuke mera koje smanjuju ili suzbijaju nepovoljne faktore ili uticaje na zdravlje stanovništva.
Centar svojim zdravstveno vaspitnim aktivnostima promoviše zdrave stilove života.
Centar vodi evidencije, prikuplja i obrađuje podatke i izveštava nadležne državne službe, službe lokalne samouprave, zdravstvene ustanove o rezultatima rada u pojedinim segmentima, kao i javnost, putem sredstava javnog informisanja.